Die gefeierte Mezzosopranistin Marie-Claude Chappuis singt regelmäßig unter der Leitung vieler berühmter Dirigenten wie Riccardo Chailly, Sir John Eliot Gardiner, Daniel Harding, Emmanuelle Haïm, René Jacobs, Zubin Mehta, Riccardo Muti, Jonathan Nott und Christophe Rousset. Sie hat zwei Grammy-Nominierungen, eine Nominierung für den Swiss Music Award und den Midem Classical Prize erhalten.
Zu den Meilensteinen ihrer Karriere zählen Idomeneo (Idamante), inszeniert und dirigiert von Nikolaus Harnoncourt in Graz und Zürich, Paisiellos Il matrimonio inaspettato (Contessa) unter Riccardo Muti bei den Salzburger Festspielen, La Damnation de Faust (Marguerite) unter Sir Roger Norrington in Leipzig und L'incoronazione di Poppea (Ottavia) an der Berliner Staatsoper und an der La Monnaie in Brüssel, eine ihrer zahlreichen Kooperationen mit René Jacobs. Für ihre Darbietungen in der Titelrolle von Purcells Dido und Aeneas wurde Chappuis in ganz Europa bejubelt. Sie ist am Maggio Musicale Fiorentino, am Theater an der Wien, am Théâtre des Champs-Elysées in Paris, am Teatro alla Scala, am Teatro Real in Madrid und am Grand Théâtre de Genève zu hören.
Ebenso aktiv ist sie auf der Konzertbühne, wo sie kürzlich mit dem Gewandhausorchester Leipzig, dem Orchestre de la Suisse Romande, dem Giardino Armonico, dem London Philharmonic Orchestra und den Wiener Philharmonikern auftrat.
Ihre Diskografie umfasst mehrere Aufnahmen mit René Jacobs (Harmonia Mundi) und dem Freiburger Barockorchester: La clemenza di Tito, La finta giardinera und das Mozart-Requiem. Weitere Aufnahmen mit Jacobs und der Akademie für alte Musik Berlin und dem RIAS Kammerchor umfassen Bachs h-Moll-Messe und Telemanns Brockes-Passion (Harmonia Mundi). Weitere Aufnahmen umfassen Beethovens 9. Symphonie unter der Leitung von Giovanni Antonini (Sony) und Bachs Matthäus-Passion mit Riccardo Chailly (Decca). Zu den Soloalben gehören Sous l'empire d'Amour (Harmonia Mundi 2017) mit dem Lautenisten Luca Pianca und Au cœur des Alpes (Sony Classical 2018). Kürzlich erschienen sind eine neue Aufnahme von Clérambaults Les Fables de La Fontaine (B-Records) mit Valentin Tournet und La Chapelle Harmonique sowie das Johannes Brahms gewidmete Album Aber die Liebe ... mit dem Pianisten Christian Chamorel und dem Quartett Sine Nomine (Prospero 2023).