Als Absolventin der Accademia di Belle Arti di Brera (Mailand) war Claudia Pernigotti von 2000 bis 2013 Leiterin der Kostümabteilung am Teatro Comunale di Bologna und hat die Kostüme für zahlreiche Aufführungen in verschiedenen italienischen und ausländischen Theatern unter der Regie von R. Recchia, D. Michieletto, G. Gallione, A. Antoniozzi und N. Garella entworfen.
Im Laufe der Jahre hat sich eine künstlerische Zusammenarbeit mit der Regisseurin Rosetta Cucchi entwickelt, für deren Inszenierungen sie Kostüme entworfen hat, so etwa für Tutti in maschera für das Wexford Opera Festival 2008, Il viaggio a Reims und Le nozze di Figaro am Teatro Comunale di Piacenza, Rodelinda, Zaira und Griselda beim Festival della Valle d‘Itria 2010, 2012 und zuletzt 2021, La Cenerentola für den Circuito Lirico Lombardo 2010, The Servant am Teatro Rossini di Lugo 2011, Cavalleria rusticana, La vida breve und Idomeneo am Theater Lübeck in den Jahren 2011 und 2012, Sweeney Todd und Werther am Teatro Comunale di Bologna, La traviata am Teatro Comunale Pavarotti di Modena, Rigoletto und La Gioconda am Theater St. Gallen, Don Giovanni im Opera Auditorium von Teneriffa, L‘Arlesiana, Salome und Resurrezione beim Wexford Festival 2012 und 2014, Fedora, Don Giovanni und Salome am Teatro Carlo Felice in Genua, Resurrezione erneut am Teatro del Maggio 2019 und La favorite am Gran Teatro la Fenice und am Opernhaus von Lüttich.
Ebenfalls unter der Regie von Rosetta Cucchi debutierte sie 2018 beim Rossini Opera Festival mit Adina, die dann 2019 beim Wexford Opera Festival wiederaufgenommen wurde. Im Januar 2021 schuf sie die Kostüme für den Opernfilm Adriana Lecouvreur, der von Rai 5 ausgestrahlt und am Teatro Comunale di Bologna gedreht wurde. Im Februar 2023 gab sie ihr Debut am Sidney Opera House mit Adriana Lecouvreur. Im Oktober desselben Jahres schuf Pernigotti die Kostüme für La ciociara beim Wexford Opera Festival.